2 - مكتبة السيّد حسن آقا مير القزوينيّ وهي الخزانة العائدة للسيد محمّد حسن آقا مير القزوينيّ الموسويّ ، المتوفّى يوم 26 رجب سنة 1380 ه ، وبالرغم ممّا بيع منها بعد وفاته فهي اليوم لا تزال في عداد الخزائن المهمّة في المدينة ، وكانت حاوية لكتب المذاهب الخمسة ، وفيها مخطوطاتٌ قيّمةٌ في الفقه والأُصول والتاريخ والحديث ، تقع مكتبته في داره بمحلة باب النجف . 3 - مكتبة السيّد محمّد مهدي الحجّة الطباطبائيّ وهي خزانةٌ ثمينةٌ حوَتْ كلّ طريفٍ من كتب التراجم والأدب والحديث ، عائدةٌ للسيّد محمّد مهدي الحجّة ابن السيّد أبي القاسم الحجّة الطباطبائيّ ، المتوفّى سنة 1342 ه ، وهي اليوم في حيازة نجله السيّد عبّاس الحجّة ، تقع مكتبته في داره بمحلّة باب النجف . 4 - مكتبة السيّد محمّد هادي الخراسانيّ وهي الخزانة العائدة للسيّد محمّد هادي ابن السيّد علي الخراسانيّ ، المتوفّى 12 ربيع الأوّل سنة 1368 ه ، وكان حسن الشعر بالفارسيّة والعربيّة ، اشتملت خزانته على نسخٍ خطّيةٍ نادرةٍ ، منها بعض المصاحف النفيسة التي جمعها وصنّفها منذ صباه ، وعدّة هذه الخزانة ( 2000 ) كتابٍ ، تقع مكتبته في داره بمحلّة باب الطاق . 5 - مكتبة الشيخ محمّد مهديّ المازندرانيّ كان المرحوم الشيخ محمّد مهدي ابن الشيخ عبد الهادي المازندرانيّ ، المتوفّى 14 ذي القعدة سنة 1385 ه‌واعظاً جليل القدر ، تضمّ خزانته كثيراً من كتب الفقه والأُصول ، ونفائس المخطوطات الأثريّة القديمة ، وهي اليوم محفوظةٌ في جناحٍ خاصٍّ من مدرسته التي تقع خلف مقام المخيم الحسيني بمحلّة المخيّم .